Если субсидии направлены автономным учреждением на выполнение госзадания
Минфин России в письме от 01.11.2010 № 03-03-06/4/102 разъяснил вопросы учета в целях налогообложении прибыли полученных автономными учреждениями из областного бюджета субсидий, направленных на выполнение задания, устанавливаемого учредителем.
Как гласит подп. 14 п. 1 ст. 251 НК РФ при формировании базы по налогу на прибыль не учитываются доходы в виде имущества, полученного налогоплательщиком в рамках целевого финансирования. При этом налогоплательщики, получившие средства целевого финансирования, обязаны вести раздельный учет доходов (расходов), полученных (произведенных) в рамках целевого финансирования.
При отсутствии такого учета у налогоплательщика, получившего средства целевого финансирования, указанные средства рассматриваются как подлежащие налогообложению с даты их получения.
К средствам целевого финансирования относится имущество, полученное налогоплательщиком и использованное им по назначению, определенному организацией (физическим лицом) - источником целевого финансирования или федеральными законами, в частности, в виде бюджетных ассигнований, выделяемых бюджетным учреждениям, а также в виде субсидий автономным учреждениям.
Соответственно, при выполнении вышеуказанных условий средства в виде субсидий, полученных автономным учреждением из областного бюджета, на выполнение задания, установленного учредителем, при формировании налоговой базы по налогу на прибыль организаций не учитываются.