НДФЛ не зависит от особенностей оплаты труда
Форма и порядок выплаты вознаграждения за выполнение трудовых обязанностей (наличными через кассу организации, в безналичном порядке путем денежного перевода на банковскую карту и др.) для целей применения положений главы 23 "Налог на доходы физических лиц" НК РФ значения не имеют (письмо Минфина России от 21.08.2014 № 03-04-06/41919).