Платишь НДФЛ там, где работаешь
В письме ФНС РФ
от 17.04.2009 N 3-5-04/460@ разъяснено, что филиалы и иные обособленные подразделения российских организаций исполняют обязанности этих организаций по уплате налогов и сборов по месту нахождения этих филиалов и иных обособленных подразделений. Следовательно, филиалы, имеющие отдельный баланс, расчетный счет и осуществляющие выплаты в пользу физических лиц, исполняют обязанности организации по исчислению, удержанию и перечислению НДФЛ по месту своего нахождения.
Вышеизложенный порядок перечисления налога применяется независимо от места жительства физического лица, а также от того, выполняются ли работы по трудовым договорам или договорам гражданско-правового характера (в том числе по договору аренды).