Заявление о возврате излишне уплаченной (взысканной) суммы государственной пошлины может быть подано в течение трех лет со дня уплаты указанной суммы. Возврат излишне уплаченной (взысканной) суммы государственной пошлины производится в течение одного месяца со дня подачи указанного заявления о возврате.
Как напомнил Минфин России в письме от 22.03.2013 № 03-05-06-03/9086, в силу п. 7 ст. 333.40 НК РФ возврат или зачет излишне уплаченных (взысканных) сумм государственной пошлины производится в порядке, установленном главой 12 «Зачет и возврат излишне уплаченных или излишне взысканных сумм» НК РФ.
При этом положения главы 25.3 «Государственная пошлина» НК РФ не содержат норм, предусматривающих запрет начисления процентов на сумму излишне уплаченной государственной пошлины, если возврат данной суммы осуществляется государственным органом с нарушением срока.
Арбитражные суды признают правомерным начисление процентов за несвоевременный возврат государственной пошлины в порядке, определенном статьей 78 НК РФ (см. постановления ФАС Московского округа от 20.12.2010 по делу № А40-33184/10-114-175, ФАС Западно-Сибирского округа от 20.07.2010 по делу № А81-5829/2009).